Çevrimiçi İşbirlikli Öğrenme'nin dezavantajları arasında, öğrenme ortamı, öğretim ve öğrenme araçları, zaman yönetimi ve motivasyon gibi faktörler yer alır. Çevrimiçi İşbirlikli Öğrenme, öğrencilerin kendilerini dış dünyadan izole hissetmesine neden olabilir. Öğrenciler, gerçek dünya deneyimlerinden yoksun kalabilir ve sosyalleşme fırsatlarından yararlanamaz. Çevrimiçi İşbirlikli Öğrenme, öğrencilerin kendi hızlarında çalışabilmelerine ve kendi programlarını oluşturabilmelerine olanak tanır. Bu, öğrencilerin belirli bir program ya da zaman çizelgesine bağlı kalmasını zorlaştırabilir. Çevrimiçi İşbirlikli Öğrenme, öğrencilerin motivasyonunu ve bağlılığını azaltabilir. Öğrencilerin, kendilerini yalnız ve izole hissettiği durumlarda motivasyon ve bağlılıklarını sürdürmeleri zor olabilir. Öğrenciler, çevrimiçi öğrenme ortamında bir araya gelerek oluşturdukları ilişkilerden yoksun kalabilir. Çevrimiçi İşbirlikli Öğrenme, öğrenciler için sosyal ve duygusal öğrenme fırsatlarını sınırlayabilir. Öğrencilerin, gerçek dünya sosyal etkileşimleri yoluyla kazanılan sosyal becerilerden yoksun kalması mümkündür. Çevrimiçi İşbirlikli Öğrenme, öğrenme ortamında öğrencilere rehberlik ve destek sağlamada zorluklar yaratabilir. Öğretmenler, öğrencilerin ihtiyaçlarını ve başarılarını izlemede zorluklar yaşayabilir. Öğrencilerin, gerçek dünya etkileşimlerinden yoksun olmaları, çevreleri hakkında gerçekçi bir anlayış geliştirmelerini zorlaştırabilir. Çevrimiçi İşbirlikli Öğrenme, öğrencilerin gerçek dünya becerileri kazanmasını zorlaştırabilir. Öğrencilerin, gerçek dünya ortamlarında uygulanan becerilerden yoksun kalması mümkündür. Çevrimiçi İşbirlikli Öğrenme, öğrencilerin gerçek dünya sorunlarını çözme yeteneklerini geliştirme fırsatlarını sınırlayabilir. Öğrencilerin, gerçek dünya ortamlarında karşılaşılan gerçek dünya sorunlarını çözme fırsatlarından yoksun kalması mümkündür. Çevrimiçi İşbirlikli Öğrenme, öğrencilerin gerçek dünya becerileri kazanmasını zorlaştırabilir. Öğrencilerin, gerçek dünya ortamlarında uygulanan becerilerden yoksun kalması mümkündür. Çevrimiçi İşbirlikli Öğrenme, öğrencilerin gerçek dünya sorunlarını çözme yeteneklerini geliştirme fırsatlarını sınırlayabilir. Öğrencilerin, gerçek dünya ortamlarında karşılaşılan gerçek dünya sorunlarını çözme fırsatlarından yoksun kalması mümkündür.